DNA-lib-screen 研究

I need to get messy calculation done. After that, some combinatorial issue will appear that might be interesting. In truth, the bias correction of BP may be realized by modified BP?? that's my hope.

組み合わせの計算が煩雑でなかなか終了しません。

e-曲率の計算は変数の添字のあいだの包含関係を使って簡単に表現できそうです。これは LDPC でも同じ。 途中までの計算を tex にまとめています。

高次項と grouping の関連を詳細に計算すれば、group test のmarginal の計算精度を上げられると考えています。これはこれで一種の design でしょう。推論ではなく計算の観点から design を考えるのは面白いかもしれません。LDPCで exact に出ているのでしょ…

LDPC 論文の話を DNA lib として書き直すと、対応が見てとれます。

Stochastic Reasoning, Free Energy, and Information Geometry: I have some ambiguity on the relation of BP and its geometical view. After a bit calculation, I got to grasp some, but yet... m_{ji}(x_i) sum_{x_j}φ(xi,xj)e^{..xj}.

Ikeda et al 論文の勉強 MPMと推定量のずれが e-曲率とどう関係するかについて、計算を追いました。計算は簡単ですが、rescaling の正当性が納得しきれていません。

BNPD関連で Turbo coding の info-geo by Ikeda et al (IEEE trans. IT) を読んでいます。幾何的位置関係が分かりやすく記述されています。 Graphに関する計算に目を通す必要があります。